Светофор - это единое целое. Конкретно Ваше направление регулируется доп. секцией. Что и как там регулируется основной секцией - Вас касается только с точки зрения приоритета - при основном красном должны уступать автомобилям с других направлений. Никакой отмены сигнала дополнительной секции сигнал основной секции не осуществляет. Пункт 6.3 ПДД продолжает действовать в полную силу:
Выключенный сигнал дополнительной секции или включенный световой сигнал красного цвета ее контура означает запрещение движения в направлении, регулируемом этой секцией.
Контурные стрелки на основной секции - для дополнительного информирования о наличии доп. секции (если доп. секцию трудно увидеть). Но Вы, судя по вопросу, о наличии доп. секции проинформированы, и в дополнительном информировании не нуждаетесь, соответственно, нет нужды в контурных стрелках. Хотя в темное время суток при отсутствии красного колечка на доп. секции эти стрелки бы не помешали...