Сергей-974, поискал дополнительную информацию по данному вопросу. В основном все склоняются к тому, что договор между ИП и физическим лицом не требуется.
Что касается регистрации в ГИБДД. Сотрудники указывают в регистрационных документах данные из договора купли-продажи. То есть, если договор оформлен на физическое лицо, то в регистрационных документах пишут физическое лицо, если на ИП, то и указывают ИП.
Попробуйте позвонить в организацию, где Вы планируете получать лицензию (в своем регионе), и уточнить у них, как получить лицензию предпринимателю, у которого автобус оформлен на физическое лицо. Исходя из этого и действуйте.
Удачи на дорогах!