Елена-351, здравствуйте.
1. Как правило, если выносится штраф за стоянку в месте, где создаются помехи для движения других транспортных средств, в постановлении или протоколе имеется дополнительная информация по поводу создания помех. Например, там могут быть слова свидетеля (другого водителя), движению которого были созданы помехи.
2. Теоретически Вы можете оспорить штраф за создание помех и в этом случае у Вас останется штраф за парковку на расстоянии менее 5 метров от пересечения проезжих частей.
3. Пункт 12.4 относится ко всем пересечениям проезжих частей, а не только к перекресткам.
Удачи на дорогах!