Александр-624, если срок лишения только начинается, то имеет смысл сдать удостоверение тракториста машиниста, т.к. без его сдачи, действительно, срок лишения считаться не должен.
Если же срок лишения уже подходит к концу, а удостоверение тракториста ранее не было сдано, то можно попробовать вернуть водительское удостоверение без сдачи удостоверения тракториста. Иногда это заканчивается успехом, т.к. данные ГИБДД и Гостехнадзора не всегда бывают синхронизированы.